兵权从兵部转移到军机处刘钧这样做不是为了多此一举，而是为了夺权，他并不仅满足于只管着直隶总督下的两个军他这个顾命大臣，想要通过设立军机处，明正言顺的掌控天下调兵权，哪怕暂时这个权利也不可能他独掌
“陛下，军机处为陛下的军事参谋顾问处，直接向陛下报告”
朱慈烺听说这个军机处直接向他报告，等于他就有权直接参与调兵指挥等决策，不由大感兴趣
“陛下，臣认为，以后军机处总领军务兵部之外，还当另设枢密院兵部以后管军政，枢密院管军令一个拥统兵权，一个指调兵权”
周延儒看皇帝对这提议十分有兴趣，不由的面色微变
他打断刘钧，质问，“之前也是郡王提议撤除五军都督府和天下卫所，如今时隔不久，却又要设立军机处和枢密院，请问这个枢密院与原来的五军都督府有何区别？这不是朝令夕改，有如儿戏？”
“当然不是如此简单”刘钧道，“我朝原来设立兵部与五军都督府，分掌军政军令但随着卫所的驰废，都督府实际早已经名存实亡，其职权都尽为兵部侵夺各地卫所撤除之后，五军都督府自然无保留意义”
“但是军令军政不分，也是一大隐患为了更高效更清晰的统兵调兵，有必要重新分开军政军令系统建立枢密院，并不是恢复五军都督府”
说到这里，刘钧拿出一个卷轴，打开
上面是一张图表，用图形清楚的把大明军队未来的指挥体系重新标明，一目了然
在这张图上，大明皇帝是整个大明军队的最高指挥决策者，在皇帝之下，是由四顾命大臣为主的军机处
然后往下，分别是兵部和枢密院
以后兵部将是一个军政系统，负责的是军队的行政、后勤、装备、以级武官的选拔、晋升、赏罚等兵部下面，在原来的各司外，还将设立陆军司、海军司和总装备司、总后勤司等
而枢密院则是军令系统，握有调令兵枢密院设枢密使，下面设有总参谋司、以及五军司令部，他们领导天下各个军区和军镇
刘钧的这套指挥体系里面，军机处成为军事最高决策中心，而兵部改为军政系统，负责的是行政后勤这一体系大明军队的指挥链条，将是皇帝-军机处-枢密使-总参-五军司令部-各军区-军镇为基本链条，负责大明军队的作战指挥、控制、协调和训练等
“军机处直接向皇帝负责，其成员为四顾命大臣、兵部尚书、枢密使、总参谋长、前后左右中五军司令、以及陆军司令、海军司令、总装备司长、总后勤司长”
整个军机处核心成员达到十六人
军机处是枢密院和兵部的上级，沟通皇帝、总理处和下面的兵部与枢密院
这是一个很复杂的结构，不过聪明如周延儒、吴甡等人还是一眼看出